PCR試驗(yàn)試劑與耗材對(duì)檢測質(zhì)量影響
PCR試驗(yàn)試劑與耗材對(duì)檢測質(zhì)量:
在PCR檢測質(zhì)量控制中,試劑的選擇具有十分重要的作用,也是實(shí)驗(yàn)人員為關(guān)注的檢測質(zhì)量控制因素。試劑一定選擇質(zhì)量和信譽(yù)好的**,一但選定后不要輕易改換。如果必須改換時(shí)應(yīng)與原產(chǎn)品進(jìn)行嚴(yán)格比對(duì)試驗(yàn),包括敏感性、特異性、試劑保存期等試驗(yàn)。并且經(jīng)常要注意不同批次產(chǎn)品質(zhì)量的差異。比如說TaqDNA聚合酶,不同廠家**的質(zhì)量是有差異的,盡管都是標(biāo)出相同活性單位,但其標(biāo)定方法和保存液的成分以及運(yùn)輸過程的不同常常導(dǎo)致實(shí)際活性單位是有差異的,有時(shí)由于其活性低,使得弱陽性樣品漏檢;有時(shí)由于其活性過高出現(xiàn)非特異擴(kuò)增。這與ELISA檢測中酶結(jié)合物的作用相似。其實(shí)影響PCR檢測結(jié)果的試劑很多,可以這樣說,PCR檢測用的所有試劑都可能影響檢測效果??刂圃噭┑馁|(zhì)量是作好PCR檢測前提。我們認(rèn)為:是選擇PCR試劑盒來控制試劑質(zhì)量。
評(píng)價(jià)一種PCR試劑盒,除了考慮它的敏感性、特異性、穩(wěn)定性、操作簡便程度外,還應(yīng)包括:試劑盒提供的試劑覆蓋整個(gè)PCR檢測試驗(yàn)的程度。如果試劑盒提供了整個(gè)PCR檢測試驗(yàn)的試劑,表明該試劑盒對(duì)PCR檢測試驗(yàn)的試劑具有了全程控制性能。相反,PCR檢測的試劑的質(zhì)量控制程度比較低,意味著檢測質(zhì)量可控程度低。例如:溴化乙錠僅僅起熒光染料的作用,如果在陽光下長時(shí)間的照射下失效了,在紫外燈下發(fā)熒光效能降低,可能會(huì)造成一些弱陽性樣品的漏檢,出現(xiàn)假陰性。其它試劑出現(xiàn)問題也是一樣影響檢測質(zhì)量。試劑盒在**過程中,有一套試劑**質(zhì)量控制體系。每一試劑組分都經(jīng)過靈敏度、敏感性、特異性質(zhì)量控制的檢測,在有效期內(nèi)能確保每種試劑的質(zhì)量。因此,選擇試劑盒進(jìn)行PCR檢測是比較理想的控制方法。在PCR檢測中,全部使用試劑盒提供試劑,對(duì)PCR檢測質(zhì)量控制有益。
實(shí)驗(yàn)耗材也是影響PCR檢測質(zhì)量的因素之一。PCR反應(yīng)管薄厚以及傳導(dǎo)熱量性能等直接影響PCR檢測效果。在熱蓋PCR儀上一般不需要加入礦物油,但有些PCR反應(yīng)管蓋子不嚴(yán)密,導(dǎo)致擴(kuò)增過程中反應(yīng)液水份蒸發(fā),嚴(yán)重影響檢測靈敏度。PCR反應(yīng)體系是微量的,移液器的Tip頭**質(zhì)量不好時(shí),有時(shí)致使液體殘留量多或洪吸作用強(qiáng),導(dǎo)致試劑盒中試劑量不夠,配置PCR反應(yīng)體系不準(zhǔn),造成檢測質(zhì)量下降。
在每次PCR檢測時(shí),一定設(shè)立陰性對(duì)照樣品和陽性對(duì)照樣品。陰性對(duì)照樣品檢測為陰性時(shí),表明試驗(yàn)全部過程的試劑沒有受到污染;陽性對(duì)照樣品檢測為陽性時(shí),表明DNA提取(RNA提取、RNA反轉(zhuǎn)錄)、DNA擴(kuò)增和電泳鑒定工作體系正常。在陰性對(duì)照樣品和陽性對(duì)照樣品檢測結(jié)果成立的前提下,才能對(duì)檢測樣品進(jìn)行判定。因此,每次試驗(yàn)都應(yīng)設(shè)立表明DNA提取(RNA提取、RNA反轉(zhuǎn)錄)、DNA擴(kuò)增和電泳鑒定對(duì)照,只有設(shè)立試驗(yàn)全程的對(duì)照,才能證明試驗(yàn)結(jié)果成立。這一點(diǎn)對(duì)PCR和RT-PCR檢測試驗(yàn)是非常重要的。
陽性對(duì)照在試劑盒中是必須有的組分。設(shè)立陽性對(duì)照有3種類型:第1種是用檢測的病原微生物作為陽性對(duì)照。這樣的直接對(duì)照優(yōu)點(diǎn)是直觀、準(zhǔn)確、本次試驗(yàn)完整條件對(duì)照,可以說明此次試驗(yàn)是否成立。缺點(diǎn)是對(duì)檢測過程中增加了PCR污染的指數(shù)。另外,不能表明每個(gè)檢測樣品對(duì)照成立。第2種是設(shè)立一種與檢測病毒無關(guān)微生物作為陽性對(duì)照。優(yōu)點(diǎn)是降低了PCR污染的危險(xiǎn)性,并且提高了試劑盒的生物安 全性。缺點(diǎn)是僅是參考陽性對(duì)照,不夠直接、完全反映本次試驗(yàn)成立,也不能表明每個(gè)檢測樣品對(duì)照成立??蛇m合怕污染的實(shí)驗(yàn)室或要求生物安 全等級(jí)高的病原微生物的檢測。第三種是在每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)設(shè)立參考對(duì)照,除了陽性擴(kuò)增帶之外,又設(shè)立一條擴(kuò)增帶,指示每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)檢測情況。檢測為陽性時(shí)出現(xiàn)兩條不同大小擴(kuò)增帶,陰性時(shí)出現(xiàn)一條擴(kuò)增帶。這種對(duì)照設(shè)立技術(shù)要求高,成本也高些,對(duì)照效果是理想的,可以排除每個(gè)檢測樣品操作失誤或試劑出現(xiàn)問題對(duì)檢測造成的影響。由于在一個(gè)反應(yīng)管內(nèi)對(duì)兩條模板同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增,相互之間多少有一定的干擾,因此,對(duì)病原微生物檢測靈敏度或多或少有一定影響。此種對(duì)照方式可能會(huì)成為PCR對(duì)照的發(fā)展趨勢。